Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf1P15314 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf1P15314 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf1P15314 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Irf1P15314 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf1P15314 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irf1P15314 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irf1P15314 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms