Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms