Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb1P13372 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms