Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms