Protein–RNA interactions for Protein: P10923

Spp1, Osteopontin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spp1P10923 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spp1P10923 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spp1P10923 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spp1P10923 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spp1P10923 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spp1P10923 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spp1P10923 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spp1P10923 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms