Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms