Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NefmP08553 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NefmP08553 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NefmP08553 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NefmP08553 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NefmP08553 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NefmP08553 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NefmP08553 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NefmP08553 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NefmP08553 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NefmP08553 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NefmP08553 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NefmP08553 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NefmP08553 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NefmP08553 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NefmP08553 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NefmP08553 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NefmP08553 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NefmP08553 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NefmP08553 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NefmP08553 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NefmP08553 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NefmP08553 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NefmP08553 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NefmP08553 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NefmP08553 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NefmP08553 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NefmP08553 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NefmP08553 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NefmP08553 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NefmP08553 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NefmP08553 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NefmP08553 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NefmP08553 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NefmP08553 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NefmP08553 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NefmP08553 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NefmP08553 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NefmP08553 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NefmP08553 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NefmP08553 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NefmP08553 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NefmP08553 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NefmP08553 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NefmP08553 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NefmP08553 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NefmP08553 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NefmP08553 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NefmP08553 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NefmP08553 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NefmP08553 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NefmP08553 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NefmP08553 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NefmP08553 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NefmP08553 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NefmP08553 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NefmP08553 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NefmP08553 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NefmP08553 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NefmP08553 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NefmP08553 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NefmP08553 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NefmP08553 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NefmP08553 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NefmP08553 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NefmP08553 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NefmP08553 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NefmP08553 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NefmP08553 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NefmP08553 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NefmP08553 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NefmP08553 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NefmP08553 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NefmP08553 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NefmP08553 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NefmP08553 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NefmP08553 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NefmP08553 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NefmP08553 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NefmP08553 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NefmP08553 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NefmP08553 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NefmP08553 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NefmP08553 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NefmP08553 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NefmP08553 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NefmP08553 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NefmP08553 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NefmP08553 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NefmP08553 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NefmP08553 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NefmP08553 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NefmP08553 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NefmP08553 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NefmP08553 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NefmP08553 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NefmP08553 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NefmP08553 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NefmP08553 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NefmP08553 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms