Protein–RNA interactions for Protein: P08046

Egr1, Early growth response protein 1, mousemouse

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr1P08046 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Egr1P08046 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Egr1P08046 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Egr1P08046 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Egr1P08046 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Egr1P08046 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Egr1P08046 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Egr1P08046 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Egr1P08046 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Egr1P08046 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Egr1P08046 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Egr1P08046 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms