Protein–RNA interactions for Protein: P06324

T-cell receptor gamma chain V region DFL12, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06324 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
P06324 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06324 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06324 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06324 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06324 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06324 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06324 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06324 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06324 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06324 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06324 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06324 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06324 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06324 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
P06324 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
P06324 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06324 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06324 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06324 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06324 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06324 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06324 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06324 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06324 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06324 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06324 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
P06324 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06324 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06324 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06324 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
P06324 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06324 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06324 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06324 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06324 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06324 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06324 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06324 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06324 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06324 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06324 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06324 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06324 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06324 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
P06324 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
P06324 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P06324 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
P06324 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P06324 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06324 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
P06324 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06324 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06324 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06324 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06324 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06324 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06324 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06324 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
P06324 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06324 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06324 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06324 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06324 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06324 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06324 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06324 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06324 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06324 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06324 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06324 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06324 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06324 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06324 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06324 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06324 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06324 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06324 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06324 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06324 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06324 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06324 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06324 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06324 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06324 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06324 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06324 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06324 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06324 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06324 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06324 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
P06324 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
P06324 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06324 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
P06324 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06324 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06324 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06324 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06324 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06324 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms