Protein–RNA interactions for Protein: P04247

Mb, Myoglobin, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MbP04247 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MbP04247 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MbP04247 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MbP04247 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MbP04247 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MbP04247 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MbP04247 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MbP04247 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MbP04247 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MbP04247 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MbP04247 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MbP04247 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MbP04247 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MbP04247 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MbP04247 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MbP04247 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MbP04247 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MbP04247 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MbP04247 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MbP04247 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MbP04247 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MbP04247 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MbP04247 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MbP04247 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MbP04247 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MbP04247 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MbP04247 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MbP04247 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MbP04247 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MbP04247 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MbP04247 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MbP04247 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MbP04247 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MbP04247 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MbP04247 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MbP04247 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MbP04247 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MbP04247 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MbP04247 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MbP04247 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MbP04247 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MbP04247 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MbP04247 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MbP04247 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MbP04247 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MbP04247 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MbP04247 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MbP04247 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MbP04247 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MbP04247 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MbP04247 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MbP04247 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MbP04247 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MbP04247 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MbP04247 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MbP04247 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MbP04247 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MbP04247 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MbP04247 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MbP04247 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MbP04247 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MbP04247 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MbP04247 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MbP04247 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MbP04247 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MbP04247 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MbP04247 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MbP04247 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MbP04247 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MbP04247 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MbP04247 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MbP04247 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MbP04247 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MbP04247 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MbP04247 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MbP04247 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MbP04247 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MbP04247 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MbP04247 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MbP04247 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MbP04247 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MbP04247 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MbP04247 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MbP04247 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MbP04247 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MbP04247 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MbP04247 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MbP04247 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MbP04247 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MbP04247 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MbP04247 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MbP04247 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MbP04247 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MbP04247 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MbP04247 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MbP04247 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MbP04247 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MbP04247 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MbP04247 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MbP04247 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms