Protein–RNA interactions for Protein: P04213

T-cell receptor beta chain V region C5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04213 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P04213 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P04213 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P04213 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P04213 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P04213 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P04213 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P04213 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P04213 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P04213 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
P04213 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P04213 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P04213 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P04213 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P04213 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P04213 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P04213 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P04213 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P04213 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P04213 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P04213 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P04213 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P04213 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P04213 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P04213 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P04213 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P04213 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P04213 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P04213 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P04213 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P04213 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P04213 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P04213 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P04213 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P04213 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P04213 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P04213 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P04213 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P04213 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P04213 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P04213 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P04213 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P04213 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P04213 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P04213 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P04213 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P04213 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
P04213 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P04213 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P04213 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P04213 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P04213 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
P04213 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P04213 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P04213 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P04213 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P04213 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P04213 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P04213 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P04213 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P04213 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P04213 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P04213 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P04213 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P04213 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P04213 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P04213 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P04213 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P04213 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P04213 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P04213 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P04213 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P04213 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P04213 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
P04213 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P04213 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
P04213 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
P04213 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P04213 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P04213 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P04213 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P04213 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P04213 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P04213 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P04213 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P04213 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
P04213 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P04213 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P04213 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P04213 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P04213 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P04213 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P04213 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P04213 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P04213 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P04213 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P04213 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P04213 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P04213 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P04213 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms