Protein–RNA interactions for Protein: P04104

Krt1, Keratin, type II cytoskeletal 1, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt1P04104 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt1P04104 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt1P04104 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt1P04104 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt1P04104 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt1P04104 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt1P04104 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt1P04104 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt1P04104 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt1P04104 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms