Protein–RNA interactions for Protein: P03888

Mtnd1, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtnd1P03888 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Mtnd1P03888 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mtnd1P03888 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mtnd1P03888 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mtnd1P03888 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mtnd1P03888 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mtnd1P03888 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mtnd1P03888 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mtnd1P03888 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mtnd1P03888 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mtnd1P03888 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mtnd1P03888 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mtnd1P03888 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mtnd1P03888 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mtnd1P03888 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mtnd1P03888 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mtnd1P03888 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mtnd1P03888 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mtnd1P03888 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mtnd1P03888 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mtnd1P03888 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mtnd1P03888 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mtnd1P03888 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mtnd1P03888 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mtnd1P03888 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mtnd1P03888 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mtnd1P03888 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mtnd1P03888 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mtnd1P03888 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mtnd1P03888 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mtnd1P03888 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mtnd1P03888 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mtnd1P03888 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mtnd1P03888 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mtnd1P03888 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mtnd1P03888 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mtnd1P03888 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mtnd1P03888 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mtnd1P03888 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mtnd1P03888 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mtnd1P03888 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mtnd1P03888 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mtnd1P03888 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mtnd1P03888 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mtnd1P03888 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mtnd1P03888 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mtnd1P03888 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Mtnd1P03888 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mtnd1P03888 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mtnd1P03888 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mtnd1P03888 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mtnd1P03888 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mtnd1P03888 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mtnd1P03888 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mtnd1P03888 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mtnd1P03888 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mtnd1P03888 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mtnd1P03888 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms