Protein–RNA interactions for Protein: P02716

Chrnd, Acetylcholine receptor subunit delta, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChrndP02716 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ChrndP02716 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChrndP02716 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChrndP02716 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChrndP02716 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChrndP02716 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChrndP02716 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChrndP02716 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChrndP02716 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChrndP02716 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChrndP02716 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ChrndP02716 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ChrndP02716 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ChrndP02716 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ChrndP02716 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ChrndP02716 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ChrndP02716 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ChrndP02716 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ChrndP02716 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ChrndP02716 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ChrndP02716 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ChrndP02716 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ChrndP02716 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ChrndP02716 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ChrndP02716 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ChrndP02716 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ChrndP02716 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ChrndP02716 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ChrndP02716 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
ChrndP02716 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ChrndP02716 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ChrndP02716 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ChrndP02716 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ChrndP02716 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ChrndP02716 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ChrndP02716 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ChrndP02716 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChrndP02716 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChrndP02716 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChrndP02716 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChrndP02716 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ChrndP02716 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ChrndP02716 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ChrndP02716 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ChrndP02716 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChrndP02716 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChrndP02716 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ChrndP02716 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChrndP02716 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChrndP02716 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChrndP02716 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChrndP02716 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChrndP02716 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChrndP02716 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ChrndP02716 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChrndP02716 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChrndP02716 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChrndP02716 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChrndP02716 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChrndP02716 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChrndP02716 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChrndP02716 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChrndP02716 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ChrndP02716 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ChrndP02716 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ChrndP02716 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ChrndP02716 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChrndP02716 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChrndP02716 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChrndP02716 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ChrndP02716 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ChrndP02716 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChrndP02716 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChrndP02716 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ChrndP02716 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChrndP02716 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ChrndP02716 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChrndP02716 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChrndP02716 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ChrndP02716 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ChrndP02716 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ChrndP02716 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
ChrndP02716 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ChrndP02716 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ChrndP02716 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ChrndP02716 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ChrndP02716 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ChrndP02716 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ChrndP02716 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ChrndP02716 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ChrndP02716 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ChrndP02716 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ChrndP02716 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ChrndP02716 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ChrndP02716 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
ChrndP02716 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ChrndP02716 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ChrndP02716 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ChrndP02716 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ChrndP02716 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms