Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms