Protein–RNA interactions for Protein: P01679

Ig kappa chain V-VI region J539, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01679 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01679 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01679 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01679 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01679 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01679 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01679 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P01679 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01679 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01679 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P01679 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01679 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01679 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01679 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01679 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01679 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01679 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01679 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01679 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P01679 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01679 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01679 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01679 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01679 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01679 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01679 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01679 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01679 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01679 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01679 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01679 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01679 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01679 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01679 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01679 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01679 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01679 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01679 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01679 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01679 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01679 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01679 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01679 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01679 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01679 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01679 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01679 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01679 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01679 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01679 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01679 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01679 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01679 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01679 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01679 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01679 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01679 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01679 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01679 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01679 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01679 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01679 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01679 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01679 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01679 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01679 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01679 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01679 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01679 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01679 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01679 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01679 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01679 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01679 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01679 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01679 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01679 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01679 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01679 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01679 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01679 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01679 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01679 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01679 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01679 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01679 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01679 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01679 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01679 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01679 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01679 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01679 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01679 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01679 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01679 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01679 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01679 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01679 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01679 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01679 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms