Protein–RNA interactions for Protein: P01668

Ig kappa chain V-III region PC 7210, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01668 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01668 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01668 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01668 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01668 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01668 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01668 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01668 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01668 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01668 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01668 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01668 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01668 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01668 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01668 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01668 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01668 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01668 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01668 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01668 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01668 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01668 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
P01668 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01668 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01668 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01668 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01668 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01668 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01668 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01668 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01668 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01668 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01668 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01668 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01668 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01668 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01668 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01668 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01668 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01668 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01668 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
P01668 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01668 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01668 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
P01668 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
P01668 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01668 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01668 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01668 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01668 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01668 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01668 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01668 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01668 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01668 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01668 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01668 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01668 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01668 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01668 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01668 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01668 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01668 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01668 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01668 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01668 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01668 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
P01668 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01668 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01668 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01668 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01668 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01668 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01668 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01668 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01668 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01668 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01668 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01668 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01668 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01668 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P01668 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01668 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01668 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01668 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01668 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01668 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P01668 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01668 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01668 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01668 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01668 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01668 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01668 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01668 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01668 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P01668 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01668 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01668 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01668 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms