Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P01649 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P01649 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
P01649 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P01649 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P01649 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P01649 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P01649 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P01649 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P01649 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P01649 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P01649 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P01649 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P01649 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P01649 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
P01649 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P01649 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P01649 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P01649 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P01649 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P01649 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P01649 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P01649 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P01649 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P01649 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P01649 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P01649 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P01649 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P01649 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P01649 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P01649 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P01649 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P01649 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01649 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01649 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01649 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01649 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01649 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01649 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01649 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01649 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01649 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01649 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01649 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01649 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01649 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01649 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01649 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01649 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
P01649 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01649 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01649 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01649 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01649 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01649 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01649 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01649 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
P01649 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P01649 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P01649 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P01649 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P01649 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
P01649 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
P01649 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P01649 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
P01649 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
P01649 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P01649 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P01649 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P01649 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
P01649 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
P01649 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P01649 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
P01649 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
P01649 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
P01649 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P01649 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
P01649 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
P01649 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P01649 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P01649 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P01649 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
P01649 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
P01649 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
P01649 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
P01649 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P01649 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P01649 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P01649 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P01649 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P01649 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P01649 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P01649 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P01649 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P01649 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P01649 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
P01649 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P01649 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P01649 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
P01649 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms