Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01641 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01641 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01641 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01641 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01641 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01641 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01641 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01641 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01641 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01641 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01641 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01641 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01641 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01641 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01641 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01641 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01641 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01641 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01641 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01641 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01641 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01641 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01641 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01641 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01641 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01641 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01641 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01641 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01641 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01641 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01641 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01641 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01641 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01641 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01641 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01641 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01641 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01641 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01641 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01641 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01641 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01641 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01641 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01641 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
P01641 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01641 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
P01641 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01641 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01641 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01641 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01641 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01641 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01641 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
P01641 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P01641 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P01641 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P01641 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01641 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01641 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01641 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01641 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01641 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01641 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01641 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01641 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01641 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01641 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01641 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01641 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01641 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01641 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01641 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01641 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01641 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01641 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01641 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01641 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01641 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01641 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01641 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01641 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01641 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01641 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01641 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01641 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01641 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
P01641 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01641 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01641 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01641 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01641 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01641 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01641 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01641 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01641 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01641 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01641 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01641 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01641 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms