Protein–RNA interactions for Protein: O88958

Gnpda1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda1O88958 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms