Protein–RNA interactions for Protein: O88898

Tp63, Tumor protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp63O88898 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp63O88898 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp63O88898 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp63O88898 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp63O88898 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp63O88898 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp63O88898 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp63O88898 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp63O88898 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp63O88898 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp63O88898 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp63O88898 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp63O88898 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp63O88898 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp63O88898 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp63O88898 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tp63O88898 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tp63O88898 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tp63O88898 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tp63O88898 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tp63O88898 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp63O88898 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp63O88898 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp63O88898 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp63O88898 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp63O88898 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp63O88898 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp63O88898 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp63O88898 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp63O88898 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp63O88898 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp63O88898 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp63O88898 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp63O88898 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp63O88898 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp63O88898 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp63O88898 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp63O88898 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp63O88898 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp63O88898 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp63O88898 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp63O88898 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp63O88898 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp63O88898 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp63O88898 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp63O88898 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp63O88898 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp63O88898 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp63O88898 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp63O88898 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp63O88898 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp63O88898 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp63O88898 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp63O88898 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp63O88898 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp63O88898 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp63O88898 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp63O88898 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp63O88898 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp63O88898 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp63O88898 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp63O88898 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp63O88898 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp63O88898 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp63O88898 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp63O88898 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp63O88898 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp63O88898 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp63O88898 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp63O88898 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp63O88898 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp63O88898 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp63O88898 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp63O88898 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp63O88898 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp63O88898 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp63O88898 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp63O88898 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp63O88898 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp63O88898 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp63O88898 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp63O88898 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp63O88898 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp63O88898 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp63O88898 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp63O88898 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp63O88898 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp63O88898 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp63O88898 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp63O88898 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp63O88898 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp63O88898 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp63O88898 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp63O88898 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp63O88898 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp63O88898 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp63O88898 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp63O88898 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp63O88898 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp63O88898 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms