Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BlmO88700 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BlmO88700 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
BlmO88700 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BlmO88700 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BlmO88700 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BlmO88700 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BlmO88700 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BlmO88700 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BlmO88700 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BlmO88700 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BlmO88700 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BlmO88700 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BlmO88700 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BlmO88700 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BlmO88700 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BlmO88700 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BlmO88700 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BlmO88700 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BlmO88700 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
BlmO88700 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BlmO88700 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BlmO88700 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BlmO88700 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BlmO88700 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
BlmO88700 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BlmO88700 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BlmO88700 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
BlmO88700 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BlmO88700 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BlmO88700 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BlmO88700 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BlmO88700 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BlmO88700 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BlmO88700 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BlmO88700 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BlmO88700 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BlmO88700 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BlmO88700 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BlmO88700 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BlmO88700 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BlmO88700 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BlmO88700 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BlmO88700 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BlmO88700 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BlmO88700 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BlmO88700 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
BlmO88700 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BlmO88700 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BlmO88700 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
BlmO88700 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BlmO88700 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BlmO88700 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BlmO88700 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BlmO88700 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
BlmO88700 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
BlmO88700 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BlmO88700 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BlmO88700 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BlmO88700 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BlmO88700 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
BlmO88700 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BlmO88700 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BlmO88700 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BlmO88700 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BlmO88700 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BlmO88700 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
BlmO88700 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BlmO88700 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BlmO88700 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BlmO88700 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BlmO88700 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BlmO88700 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BlmO88700 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BlmO88700 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BlmO88700 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BlmO88700 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BlmO88700 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BlmO88700 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BlmO88700 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
BlmO88700 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BlmO88700 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BlmO88700 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BlmO88700 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
BlmO88700 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
BlmO88700 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BlmO88700 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BlmO88700 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BlmO88700 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BlmO88700 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BlmO88700 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BlmO88700 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BlmO88700 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
BlmO88700 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BlmO88700 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BlmO88700 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BlmO88700 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BlmO88700 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BlmO88700 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BlmO88700 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms