Protein–RNA interactions for Protein: O88576

Slc6a18, Sodium-dependent neutral amino acid transporter B(0)AT3, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a18O88576 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Slc6a18O88576 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a18O88576 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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