Protein–RNA interactions for Protein: O88398

Avil, Advillin, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AvilO88398 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
AvilO88398 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
AvilO88398 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AvilO88398 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AvilO88398 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AvilO88398 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AvilO88398 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AvilO88398 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AvilO88398 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AvilO88398 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AvilO88398 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AvilO88398 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AvilO88398 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AvilO88398 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AvilO88398 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AvilO88398 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AvilO88398 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AvilO88398 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AvilO88398 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AvilO88398 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AvilO88398 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AvilO88398 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AvilO88398 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
AvilO88398 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AvilO88398 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AvilO88398 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
AvilO88398 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AvilO88398 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AvilO88398 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AvilO88398 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AvilO88398 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AvilO88398 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AvilO88398 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AvilO88398 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AvilO88398 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AvilO88398 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AvilO88398 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AvilO88398 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AvilO88398 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AvilO88398 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AvilO88398 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AvilO88398 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AvilO88398 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AvilO88398 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AvilO88398 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
AvilO88398 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AvilO88398 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AvilO88398 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AvilO88398 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AvilO88398 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AvilO88398 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AvilO88398 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
AvilO88398 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
AvilO88398 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AvilO88398 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AvilO88398 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AvilO88398 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AvilO88398 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AvilO88398 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AvilO88398 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AvilO88398 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AvilO88398 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AvilO88398 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AvilO88398 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AvilO88398 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AvilO88398 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AvilO88398 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AvilO88398 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AvilO88398 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AvilO88398 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AvilO88398 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AvilO88398 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AvilO88398 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AvilO88398 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AvilO88398 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AvilO88398 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AvilO88398 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AvilO88398 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AvilO88398 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AvilO88398 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AvilO88398 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AvilO88398 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AvilO88398 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AvilO88398 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AvilO88398 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AvilO88398 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AvilO88398 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AvilO88398 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AvilO88398 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AvilO88398 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AvilO88398 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AvilO88398 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AvilO88398 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AvilO88398 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AvilO88398 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AvilO88398 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AvilO88398 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AvilO88398 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AvilO88398 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AvilO88398 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms