Protein–RNA interactions for Protein: O55127

Cyp26a1, Cytochrome P450 26A1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26a1O55127 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cyp26a1O55127 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cyp26a1O55127 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cyp26a1O55127 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cyp26a1O55127 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cyp26a1O55127 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cyp26a1O55127 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cyp26a1O55127 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cyp26a1O55127 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cyp26a1O55127 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cyp26a1O55127 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cyp26a1O55127 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cyp26a1O55127 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cyp26a1O55127 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cyp26a1O55127 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cyp26a1O55127 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cyp26a1O55127 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cyp26a1O55127 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cyp26a1O55127 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cyp26a1O55127 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cyp26a1O55127 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms