Protein–RNA interactions for Protein: O55047

Tlk2, Serine/threonine-protein kinase tousled-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlk2O55047 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tlk2O55047 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms