Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Copb2O55029 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Copb2O55029 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Copb2O55029 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Copb2O55029 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Copb2O55029 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Copb2O55029 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Copb2O55029 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Copb2O55029 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Copb2O55029 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Copb2O55029 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Copb2O55029 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Copb2O55029 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Copb2O55029 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Copb2O55029 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Copb2O55029 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Copb2O55029 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Copb2O55029 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Copb2O55029 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Copb2O55029 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Copb2O55029 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Copb2O55029 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Copb2O55029 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Copb2O55029 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Copb2O55029 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Copb2O55029 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Copb2O55029 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Copb2O55029 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Copb2O55029 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Copb2O55029 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Copb2O55029 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Copb2O55029 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Copb2O55029 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Copb2O55029 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Copb2O55029 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Copb2O55029 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Copb2O55029 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Copb2O55029 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Copb2O55029 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Copb2O55029 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Copb2O55029 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Copb2O55029 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Copb2O55029 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Copb2O55029 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Copb2O55029 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Copb2O55029 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Copb2O55029 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Copb2O55029 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Copb2O55029 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Copb2O55029 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Copb2O55029 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Copb2O55029 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Copb2O55029 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Copb2O55029 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Copb2O55029 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Copb2O55029 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Copb2O55029 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Copb2O55029 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Copb2O55029 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Copb2O55029 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Copb2O55029 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Copb2O55029 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Copb2O55029 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Copb2O55029 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Copb2O55029 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Copb2O55029 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Copb2O55029 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Copb2O55029 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Copb2O55029 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Copb2O55029 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Copb2O55029 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Copb2O55029 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Copb2O55029 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Copb2O55029 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Copb2O55029 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Copb2O55029 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Copb2O55029 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Copb2O55029 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Copb2O55029 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Copb2O55029 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Copb2O55029 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Copb2O55029 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Copb2O55029 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Copb2O55029 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Copb2O55029 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Copb2O55029 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Copb2O55029 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Copb2O55029 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Copb2O55029 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Copb2O55029 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Copb2O55029 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Copb2O55029 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Copb2O55029 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Copb2O55029 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Copb2O55029 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Copb2O55029 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Copb2O55029 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Copb2O55029 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Copb2O55029 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Copb2O55029 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms