Protein–RNA interactions for Protein: O54965

Rnf13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13, mousemouse

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Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf13O54965 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Rnf13O54965 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rnf13O54965 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rnf13O54965 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Rnf13O54965 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Rnf13O54965 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf13O54965 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf13O54965 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf13O54965 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Rnf13O54965 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Rnf13O54965 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Rnf13O54965 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Rnf13O54965 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Rnf13O54965 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Rnf13O54965 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Rnf13O54965 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf13O54965 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf13O54965 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf13O54965 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf13O54965 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf13O54965 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf13O54965 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf13O54965 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf13O54965 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf13O54965 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf13O54965 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf13O54965 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf13O54965 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf13O54965 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf13O54965 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf13O54965 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf13O54965 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf13O54965 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf13O54965 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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