Protein–RNA interactions for Protein: O54908

Dkk1, Dickkopf-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk1O54908 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Gm15680-201ENSMUST00000161597 465 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Gm42556-201ENSMUST00000201397 607 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Olfr1434-203ENSMUST00000208197 1229 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Higd1a-202ENSMUST00000213124 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Speer6-ps1-203ENSMUST00000223482 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Smr2-202ENSMUST00000196070 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Gm6312-201ENSMUST00000204060 1194 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Olfr995-201ENSMUST00000099924 1113 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 4930589L23Rik-201ENSMUST00000091023 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Mir669l-201ENSMUST00000103771 98 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Mir1192-201ENSMUST00000116976 121 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Vmn2r-ps73-201ENSMUST00000173890 1194 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Gm37573-201ENSMUST00000193993 931 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 mt-Atp6-201ENSMUST00000082408 681 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 4933411O13Rik-201ENSMUST00000050665 1464 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dkk1O54908 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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