Protein–RNA interactions for Protein: O35912

Emp3, Epithelial membrane protein 3, mousemouse

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Length 163 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emp3O35912 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Emp3O35912 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Emp3O35912 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Emp3O35912 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Emp3O35912 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Emp3O35912 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Emp3O35912 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Emp3O35912 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Emp3O35912 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Emp3O35912 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms