Protein–RNA interactions for Protein: O35685

Nudc, Nuclear migration protein nudC, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NudcO35685 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NudcO35685 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NudcO35685 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NudcO35685 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NudcO35685 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NudcO35685 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NudcO35685 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NudcO35685 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NudcO35685 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NudcO35685 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NudcO35685 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NudcO35685 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NudcO35685 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NudcO35685 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NudcO35685 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NudcO35685 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NudcO35685 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NudcO35685 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NudcO35685 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NudcO35685 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NudcO35685 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NudcO35685 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NudcO35685 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NudcO35685 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NudcO35685 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NudcO35685 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NudcO35685 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NudcO35685 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NudcO35685 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NudcO35685 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NudcO35685 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NudcO35685 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NudcO35685 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NudcO35685 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NudcO35685 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NudcO35685 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NudcO35685 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NudcO35685 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NudcO35685 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NudcO35685 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NudcO35685 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NudcO35685 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NudcO35685 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NudcO35685 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NudcO35685 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NudcO35685 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NudcO35685 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NudcO35685 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NudcO35685 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NudcO35685 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NudcO35685 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NudcO35685 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NudcO35685 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NudcO35685 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NudcO35685 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NudcO35685 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NudcO35685 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NudcO35685 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NudcO35685 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NudcO35685 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NudcO35685 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NudcO35685 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NudcO35685 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NudcO35685 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NudcO35685 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NudcO35685 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NudcO35685 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NudcO35685 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NudcO35685 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NudcO35685 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NudcO35685 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
NudcO35685 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NudcO35685 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NudcO35685 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NudcO35685 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NudcO35685 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NudcO35685 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NudcO35685 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NudcO35685 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NudcO35685 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NudcO35685 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NudcO35685 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NudcO35685 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NudcO35685 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NudcO35685 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NudcO35685 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NudcO35685 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NudcO35685 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NudcO35685 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NudcO35685 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NudcO35685 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
NudcO35685 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NudcO35685 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NudcO35685 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NudcO35685 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NudcO35685 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NudcO35685 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NudcO35685 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NudcO35685 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NudcO35685 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms