Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhx8O35652 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhx8O35652 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhx8O35652 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhx8O35652 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhx8O35652 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhx8O35652 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhx8O35652 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhx8O35652 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhx8O35652 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhx8O35652 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhx8O35652 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhx8O35652 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhx8O35652 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhx8O35652 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhx8O35652 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhx8O35652 Gm42619-201ENSMUST00000197564 1136 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhx8O35652 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhx8O35652 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhx8O35652 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhx8O35652 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Olfr838-ps1-201ENSMUST00000211872 977 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Gm11834-201ENSMUST00000122257 585 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Prol1-201ENSMUST00000170832 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Gm42438-201ENSMUST00000197832 974 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Gm12600-201ENSMUST00000146704 708 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms