Protein–RNA interactions for Protein: O35493

Clk4, Dual specificity protein kinase CLK4, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk4O35493 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clk4O35493 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Clk4O35493 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk4O35493 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk4O35493 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk4O35493 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms