Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clk2O35491 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clk2O35491 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Clk2O35491 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clk2O35491 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clk2O35491 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clk2O35491 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Clk2O35491 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clk2O35491 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Clk2O35491 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clk2O35491 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clk2O35491 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Clk2O35491 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clk2O35491 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clk2O35491 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clk2O35491 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clk2O35491 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clk2O35491 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clk2O35491 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clk2O35491 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clk2O35491 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clk2O35491 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clk2O35491 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clk2O35491 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clk2O35491 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clk2O35491 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clk2O35491 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clk2O35491 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clk2O35491 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clk2O35491 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clk2O35491 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clk2O35491 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clk2O35491 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clk2O35491 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clk2O35491 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clk2O35491 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clk2O35491 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clk2O35491 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clk2O35491 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clk2O35491 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clk2O35491 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clk2O35491 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clk2O35491 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clk2O35491 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Clk2O35491 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clk2O35491 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clk2O35491 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clk2O35491 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clk2O35491 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clk2O35491 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clk2O35491 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clk2O35491 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clk2O35491 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clk2O35491 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clk2O35491 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clk2O35491 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clk2O35491 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Clk2O35491 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Clk2O35491 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Clk2O35491 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clk2O35491 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clk2O35491 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clk2O35491 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clk2O35491 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clk2O35491 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clk2O35491 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clk2O35491 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clk2O35491 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clk2O35491 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clk2O35491 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clk2O35491 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clk2O35491 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clk2O35491 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clk2O35491 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clk2O35491 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clk2O35491 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clk2O35491 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clk2O35491 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Clk2O35491 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clk2O35491 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clk2O35491 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clk2O35491 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clk2O35491 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clk2O35491 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Clk2O35491 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clk2O35491 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clk2O35491 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clk2O35491 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clk2O35491 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clk2O35491 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clk2O35491 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clk2O35491 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clk2O35491 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clk2O35491 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clk2O35491 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clk2O35491 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clk2O35491 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clk2O35491 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clk2O35491 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clk2O35491 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms