Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms