Protein–RNA interactions for Protein: O35448

Ppt2, Lysosomal thioesterase PPT2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppt2O35448 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppt2O35448 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppt2O35448 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppt2O35448 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppt2O35448 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppt2O35448 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppt2O35448 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppt2O35448 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppt2O35448 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppt2O35448 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppt2O35448 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppt2O35448 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppt2O35448 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppt2O35448 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppt2O35448 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppt2O35448 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppt2O35448 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppt2O35448 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppt2O35448 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppt2O35448 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppt2O35448 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppt2O35448 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppt2O35448 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppt2O35448 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppt2O35448 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppt2O35448 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppt2O35448 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppt2O35448 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppt2O35448 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppt2O35448 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppt2O35448 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppt2O35448 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppt2O35448 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppt2O35448 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppt2O35448 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppt2O35448 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppt2O35448 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppt2O35448 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppt2O35448 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppt2O35448 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppt2O35448 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppt2O35448 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppt2O35448 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ppt2O35448 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ppt2O35448 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ppt2O35448 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ppt2O35448 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms