Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Abcc1O35379 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Abcc1O35379 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Abcc1O35379 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Abcc1O35379 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Abcc1O35379 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
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Abcc1O35379 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Abcc1O35379 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Abcc1O35379 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Abcc1O35379 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Abcc1O35379 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Abcc1O35379 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Abcc1O35379 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Abcc1O35379 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Abcc1O35379 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Abcc1O35379 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
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Abcc1O35379 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Abcc1O35379 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Abcc1O35379 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Abcc1O35379 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Abcc1O35379 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Abcc1O35379 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Abcc1O35379 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Abcc1O35379 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Abcc1O35379 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Abcc1O35379 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Abcc1O35379 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Abcc1O35379 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Abcc1O35379 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Abcc1O35379 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Abcc1O35379 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Abcc1O35379 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Abcc1O35379 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Abcc1O35379 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Abcc1O35379 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Abcc1O35379 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Abcc1O35379 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Abcc1O35379 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Abcc1O35379 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Abcc1O35379 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Abcc1O35379 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
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Abcc1O35379 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
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Abcc1O35379 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Abcc1O35379 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
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Abcc1O35379 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Abcc1O35379 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Abcc1O35379 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
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Abcc1O35379 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
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Abcc1O35379 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
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Abcc1O35379 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Abcc1O35379 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Abcc1O35379 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Abcc1O35379 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Abcc1O35379 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Abcc1O35379 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms