Protein–RNA interactions for Protein: O35326

Srsf5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf5O35326 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Srsf5O35326 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Srsf5O35326 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srsf5O35326 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srsf5O35326 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srsf5O35326 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srsf5O35326 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srsf5O35326 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srsf5O35326 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srsf5O35326 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srsf5O35326 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srsf5O35326 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srsf5O35326 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srsf5O35326 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srsf5O35326 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srsf5O35326 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srsf5O35326 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srsf5O35326 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Srsf5O35326 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms