Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
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