Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcns1O35173 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms