Protein–RNA interactions for Protein: O09127

Epha8, Ephrin type-A receptor 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha8O09127 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Epha8O09127 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Epha8O09127 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Epha8O09127 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Epha8O09127 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Epha8O09127 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Epha8O09127 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Epha8O09127 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Epha8O09127 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Epha8O09127 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Epha8O09127 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epha8O09127 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epha8O09127 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epha8O09127 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epha8O09127 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epha8O09127 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Epha8O09127 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epha8O09127 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epha8O09127 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Epha8O09127 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epha8O09127 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epha8O09127 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epha8O09127 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Epha8O09127 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epha8O09127 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Epha8O09127 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epha8O09127 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epha8O09127 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epha8O09127 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epha8O09127 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epha8O09127 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epha8O09127 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epha8O09127 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epha8O09127 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epha8O09127 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epha8O09127 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epha8O09127 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epha8O09127 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epha8O09127 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epha8O09127 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epha8O09127 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epha8O09127 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epha8O09127 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Epha8O09127 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epha8O09127 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epha8O09127 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epha8O09127 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epha8O09127 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epha8O09127 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epha8O09127 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epha8O09127 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epha8O09127 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epha8O09127 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epha8O09127 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epha8O09127 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epha8O09127 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epha8O09127 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epha8O09127 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epha8O09127 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epha8O09127 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epha8O09127 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epha8O09127 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epha8O09127 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Epha8O09127 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epha8O09127 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epha8O09127 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epha8O09127 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Epha8O09127 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epha8O09127 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Epha8O09127 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Epha8O09127 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Epha8O09127 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epha8O09127 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epha8O09127 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epha8O09127 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epha8O09127 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epha8O09127 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Epha8O09127 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epha8O09127 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epha8O09127 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Epha8O09127 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epha8O09127 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epha8O09127 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epha8O09127 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Epha8O09127 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Epha8O09127 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Epha8O09127 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Epha8O09127 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Epha8O09127 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epha8O09127 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epha8O09127 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epha8O09127 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epha8O09127 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms