Protein–RNA interactions for Protein: O08686

Barx2, Homeobox protein BarH-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx2O08686 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Barx2O08686 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Barx2O08686 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Barx2O08686 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Barx2O08686 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Barx2O08686 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Barx2O08686 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Barx2O08686 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms