Protein–RNA interactions for Protein: L7N2C0

Gm6401, Predicted gene 6401 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6401L7N2C0 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6401L7N2C0 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6401L7N2C0 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6401L7N2C0 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6401L7N2C0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6401L7N2C0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6401L7N2C0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Gm6401L7N2C0 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6401L7N2C0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6401L7N2C0 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6401L7N2C0 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6401L7N2C0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6401L7N2C0 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6401L7N2C0 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6401L7N2C0 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gm6401L7N2C0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gm6401L7N2C0 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gm6401L7N2C0 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Gm6401L7N2C0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Gm6401L7N2C0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Gm6401L7N2C0 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Gm6401L7N2C0 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6401L7N2C0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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