Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Gm20878L7N244 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
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Gm20878L7N244 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
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Gm20878L7N244 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Gm20878L7N244 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Gm20878L7N244 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20878L7N244 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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