Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21976J3QNN2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21976J3QNN2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21976J3QNN2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21976J3QNN2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21976J3QNN2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21976J3QNN2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21976J3QNN2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21976J3QNN2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21976J3QNN2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21976J3QNN2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21976J3QNN2 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21976J3QNN2 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21976J3QNN2 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21976J3QNN2 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21976J3QNN2 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21976J3QNN2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21976J3QNN2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21976J3QNN2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21976J3QNN2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21976J3QNN2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21976J3QNN2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21976J3QNN2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21976J3QNN2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21976J3QNN2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21976J3QNN2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21976J3QNN2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21976J3QNN2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21976J3QNN2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21976J3QNN2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21976J3QNN2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21976J3QNN2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21976J3QNN2 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21976J3QNN2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Gm21976J3QNN2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21976J3QNN2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21976J3QNN2 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21976J3QNN2 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Gm21976J3QNN2 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Gm21976J3QNN2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21976J3QNN2 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21976J3QNN2 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21976J3QNN2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21976J3QNN2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21976J3QNN2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21976J3QNN2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21976J3QNN2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21976J3QNN2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21976J3QNN2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21976J3QNN2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21976J3QNN2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Gm21976J3QNN2 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Gm21976J3QNN2 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Gm21976J3QNN2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21976J3QNN2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21976J3QNN2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21976J3QNN2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21976J3QNN2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21976J3QNN2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21976J3QNN2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21976J3QNN2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21976J3QNN2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Gm21976J3QNN2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms