Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms