Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pot1bH7BX60 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pot1bH7BX60 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms