Protein–RNA interactions for Protein: H3BJN7

Gm20696, Predicted gene 20696, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20696H3BJN7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20696H3BJN7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20696H3BJN7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20696H3BJN7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20696H3BJN7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20696H3BJN7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20696H3BJN7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20696H3BJN7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20696H3BJN7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20696H3BJN7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20696H3BJN7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20696H3BJN7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm20696H3BJN7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20696H3BJN7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm20696H3BJN7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20696H3BJN7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm20696H3BJN7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20696H3BJN7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20696H3BJN7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20696H3BJN7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20696H3BJN7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20696H3BJN7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20696H3BJN7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20696H3BJN7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20696H3BJN7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20696H3BJN7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20696H3BJN7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm20696H3BJN7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20696H3BJN7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20696H3BJN7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20696H3BJN7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20696H3BJN7 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20696H3BJN7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20696H3BJN7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20696H3BJN7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20696H3BJN7 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20696H3BJN7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20696H3BJN7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20696H3BJN7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20696H3BJN7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20696H3BJN7 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20696H3BJN7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20696H3BJN7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20696H3BJN7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20696H3BJN7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20696H3BJN7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm20696H3BJN7 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20696H3BJN7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20696H3BJN7 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20696H3BJN7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20696H3BJN7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20696H3BJN7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20696H3BJN7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20696H3BJN7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20696H3BJN7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20696H3BJN7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm20696H3BJN7 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20696H3BJN7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20696H3BJN7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20696H3BJN7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20696H3BJN7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20696H3BJN7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20696H3BJN7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20696H3BJN7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20696H3BJN7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20696H3BJN7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm20696H3BJN7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20696H3BJN7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20696H3BJN7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm20696H3BJN7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20696H3BJN7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20696H3BJN7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20696H3BJN7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20696H3BJN7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20696H3BJN7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20696H3BJN7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20696H3BJN7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20696H3BJN7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20696H3BJN7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20696H3BJN7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20696H3BJN7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20696H3BJN7 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20696H3BJN7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20696H3BJN7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20696H3BJN7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20696H3BJN7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20696H3BJN7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20696H3BJN7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20696H3BJN7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm20696H3BJN7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20696H3BJN7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20696H3BJN7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm20696H3BJN7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20696H3BJN7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20696H3BJN7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20696H3BJN7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20696H3BJN7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20696H3BJN7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20696H3BJN7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20696H3BJN7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms