Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms