Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms